我国构建世界首个番茄超泛基因组

今日新闻 2023-04-11126网络整理知心

  由新疆农科院加工番茄生物育种创新团队牵头,连系中国农业科学院、新疆大学、新疆农业大学等多家单元,乐成构建了国际首个番茄超泛基因组。4月6日,相干科研成就以《超泛基因组研究显现野生和种植番茄物种基因组和布局变异多样性》为题在线颁发于国际学术期刊《天然·遗传》。

  番茄(Solanum lycopersicum L.)是果实遗传、发育和心理研究的经典模子体系,也是环球出产中最重要的蔬菜作物。因为人们为追求更大的果实和更高的产量,对种植番茄举办麋集人工选择,致使今朝番茄遗传多样性大幅损失,改善进程存在严峻瓶颈。对比之下,蛮横人茄在各生态情形下示意出普及的遗传和表型多样性,其富厚的等位基因变异、更强的耐生物胁迫和非生物胁迫性、高程度的可溶性固体含量、番茄红素和风味化合物以及高分枝手段对当代育种具有重要意义。

  该团队研究网络了8个蛮横人茄种、1个番茄近源野生种和2个种植番茄代表性品种,操作PacBio(第三代单分子及时测序技能)、Bionano(全基因组光学图谱技能)和Hi-C(高通量染色体构象捕捉技能)测序技能,组装了11个染色体程度高质量基因组,理会了番茄属基因组特性,重构了番茄属体系产生相关,构建了国际首个番茄超泛基因组,为群体程度SV基因分型提供了强盛的平台,这将有助于开拓风味改善番茄品种的育种标志。

  该团队操作超泛基因组,在蛮横人茄资源中克隆到一个能明显增进分枝数且果实数目增进67.1%的新基因,对此后加工番茄品种创新具有重大代价,也为其他农作物开展生物育种基本前沿研究提供了新思绪,为加速新品种选育历程开发了新偏向。(通信员许娟 赵月 李宁 记者朱彤)

原问题:我国构建天下首个番茄超泛基因组

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