我国科学家构建目前最大活跃DNA转座子数据集
6月6日从中国科学院获悉,近日,中国科学院动物研究所张勇、王皓毅研究组开展了迄今为止最大规模的DNA转座子活性筛选,构建了目前最大的活跃DNA转座子数据集,极大扩展了基于DNA转座子的基因工程工具箱。相关研究成果6月5日在线发表于《细胞》杂志。
据了解,DNA转座子也称跳跃基因,可被用作基因工程工具。DNA转座子约占人类基因组的2%,是一种天然的可以自主移动的DNA序列,可以演化为功能性基因或调控元件。
130个新型DNA转座子和20个已知活跃DNA转座子的进化树。图据中国科学院
DNA转座子跳跃是物种进化的重要动力,有助于宿主适应恶劣环境。然而,在长期演化的过程中,绝大多数的DNA转座子失去了转座活性,只有少数转座子被开发为基因整合的工具,用于基因治疗、挖掘新的基因和功能元件等。因此,亟待系统挖掘具有不同功能特点的DNA转座子工具。
此次,科研人员从102个无脊椎和脊椎动物基因组中预测了130个潜在活跃的DNA转座子,同时,通过人源细胞中的高通量实验,筛选验证了40个转座子具有异源转座活性。这一结果将哺乳动物中活跃转座子载体的数目从20个提升至60个,大幅拓展了DNA转座子的进化多样性。
基于此,科研人员进一步开展了基础研究与应用研究两个层面的系统探索,一方面解析了DNA转座子的活性相关因素和进化动态,揭示了其多样化的功能特征;另一方面也阐明了来自蚊子Mariner2_AG转座子在CAR-T细胞治疗中的优越性能和临床应用潜力。
转座因子是什么?
转座因子(又叫可移,可动因子),是一类在很多后生动物中(包括线虫、昆虫和人)发现的可移动的遗传因子。 一段DNA顺序可以从原位上单独复制或断裂下来,环化后插入另一位点,并对其后的基因起调控作用,此过程称转座。这段序列称跳跃基因或转座子分插入序列(Is因子),转座(Tn),转座phage。转座子是存在于染色体DNA上可自主复制和位移的基本单位。最简单的转座(因)子不含有任何宿主基因而常被称为插入序列(IS),它们是细菌染色体或质粒DNA的正常组成部分。转座(因)子是基因组中一段可移动的DNA序列,可以通过切割、重新整合等一系列过程从基因组的一个位置“跳跃”到另一个位置。
(封面新闻)